Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN2P35609 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACTN2P35609 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms