Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA10P31260 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms