Protein–RNA interactions for Protein: P30613

PKLR, Pyruvate kinase PKLR, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKLRP30613 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKLRP30613 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKLRP30613 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PKLRP30613 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKLRP30613 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKLRP30613 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKLRP30613 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PKLRP30613 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKLRP30613 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKLRP30613 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKLRP30613 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKLRP30613 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PKLRP30613 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKLRP30613 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKLRP30613 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKLRP30613 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKLRP30613 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PKLRP30613 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKLRP30613 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKLRP30613 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKLRP30613 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKLRP30613 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKLRP30613 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKLRP30613 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKLRP30613 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKLRP30613 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKLRP30613 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKLRP30613 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKLRP30613 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKLRP30613 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PKLRP30613 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKLRP30613 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKLRP30613 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKLRP30613 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PKLRP30613 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PKLRP30613 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PKLRP30613 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PKLRP30613 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PKLRP30613 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms