Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD10P28358 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms