Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR2AP28223 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms