Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms