Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMLP26374 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMLP26374 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMLP26374 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMLP26374 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMLP26374 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMLP26374 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMLP26374 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMLP26374 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMLP26374 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMLP26374 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMLP26374 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMLP26374 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMLP26374 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMLP26374 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMLP26374 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMLP26374 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMLP26374 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMLP26374 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMLP26374 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMLP26374 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMLP26374 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMLP26374 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMLP26374 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMLP26374 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMLP26374 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMLP26374 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMLP26374 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMLP26374 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMLP26374 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMLP26374 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMLP26374 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMLP26374 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMLP26374 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMLP26374 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMLP26374 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMLP26374 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMLP26374 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMLP26374 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMLP26374 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMLP26374 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMLP26374 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMLP26374 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMLP26374 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMLP26374 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMLP26374 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMLP26374 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMLP26374 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMLP26374 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMLP26374 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMLP26374 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMLP26374 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMLP26374 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMLP26374 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMLP26374 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMLP26374 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMLP26374 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMLP26374 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMLP26374 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMLP26374 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMLP26374 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMLP26374 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMLP26374 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMLP26374 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMLP26374 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMLP26374 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMLP26374 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMLP26374 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMLP26374 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMLP26374 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms