Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFKBIAP25963 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFKBIAP25963 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFKBIAP25963 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NFKBIAP25963 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFKBIAP25963 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFKBIAP25963 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFKBIAP25963 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFKBIAP25963 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFKBIAP25963 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFKBIAP25963 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFKBIAP25963 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFKBIAP25963 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFKBIAP25963 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFKBIAP25963 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NFKBIAP25963 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NFKBIAP25963 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFKBIAP25963 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFKBIAP25963 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFKBIAP25963 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFKBIAP25963 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFKBIAP25963 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKBIAP25963 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms