Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTAFRP25105 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms