Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCP25054 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCP25054 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCP25054 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCP25054 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCP25054 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCP25054 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCP25054 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APCP25054 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APCP25054 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APCP25054 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APCP25054 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APCP25054 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APCP25054 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APCP25054 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APCP25054 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APCP25054 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APCP25054 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APCP25054 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APCP25054 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APCP25054 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APCP25054 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
APCP25054 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APCP25054 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
APCP25054 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APCP25054 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APCP25054 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APCP25054 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APCP25054 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APCP25054 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APCP25054 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APCP25054 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APCP25054 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APCP25054 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APCP25054 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APCP25054 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APCP25054 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APCP25054 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APCP25054 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APCP25054 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APCP25054 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APCP25054 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APCP25054 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APCP25054 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APCP25054 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APCP25054 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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