Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRBP23467 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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