Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKACBP22694 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms