Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNB1P20700 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMNB1P20700 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms