Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRHP20396 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRHP20396 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRHP20396 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRHP20396 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRHP20396 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRHP20396 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRHP20396 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRHP20396 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRHP20396 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRHP20396 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRHP20396 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRHP20396 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRHP20396 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRHP20396 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRHP20396 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRHP20396 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRHP20396 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRHP20396 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRHP20396 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRHP20396 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRHP20396 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRHP20396 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRHP20396 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRHP20396 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRHP20396 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRHP20396 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRHP20396 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRHP20396 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TRHP20396 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRHP20396 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRHP20396 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRHP20396 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRHP20396 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRHP20396 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRHP20396 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRHP20396 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRHP20396 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRHP20396 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRHP20396 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRHP20396 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRHP20396 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRHP20396 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRHP20396 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TRHP20396 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRHP20396 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRHP20396 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRHP20396 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRHP20396 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRHP20396 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRHP20396 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRHP20396 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRHP20396 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRHP20396 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRHP20396 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRHP20396 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRHP20396 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRHP20396 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRHP20396 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRHP20396 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRHP20396 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRHP20396 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRHP20396 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRHP20396 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TRHP20396 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRHP20396 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRHP20396 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TRHP20396 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TRHP20396 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRHP20396 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRHP20396 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRHP20396 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRHP20396 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRHP20396 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRHP20396 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRHP20396 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRHP20396 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRHP20396 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRHP20396 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRHP20396 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRHP20396 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRHP20396 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TRHP20396 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRHP20396 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TRHP20396 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRHP20396 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRHP20396 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRHP20396 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRHP20396 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRHP20396 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRHP20396 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRHP20396 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRHP20396 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRHP20396 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRHP20396 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRHP20396 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRHP20396 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRHP20396 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRHP20396 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TRHP20396 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms