Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TRIM21P19474 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM21P19474 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM21P19474 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms