Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXB4P17483 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXB4P17483 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXB4P17483 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXB4P17483 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXB4P17483 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXB4P17483 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXB4P17483 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms