Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms