Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMC1P11047 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMC1P11047 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms