Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GLI4P10075 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GLI4P10075 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GLI4P10075 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GLI4P10075 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GLI4P10075 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GLI4P10075 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms