Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HKR1P10072 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HKR1P10072 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
HKR1P10072 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
HKR1P10072 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
HKR1P10072 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms