Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CGB3P0DN86 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms