Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM10L2BP0DMW5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms