Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MSMBP08118 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MSMBP08118 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MSMBP08118 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MSMBP08118 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MSMBP08118 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MSMBP08118 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MSMBP08118 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
MSMBP08118 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMBP08118 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMBP08118 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMBP08118 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMBP08118 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMBP08118 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMBP08118 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMBP08118 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMBP08118 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMBP08118 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMBP08118 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMBP08118 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMBP08118 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMBP08118 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMBP08118 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMBP08118 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMBP08118 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMBP08118 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMBP08118 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMBP08118 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMBP08118 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMBP08118 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MSMBP08118 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMBP08118 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MSMBP08118 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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