Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB1P08034 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB1P08034 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB1P08034 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB1P08034 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB1P08034 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB1P08034 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB1P08034 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB1P08034 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB1P08034 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB1P08034 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB1P08034 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB1P08034 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB1P08034 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB1P08034 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB1P08034 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB1P08034 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB1P08034 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB1P08034 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB1P08034 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB1P08034 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJB1P08034 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB1P08034 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB1P08034 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB1P08034 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB1P08034 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB1P08034 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB1P08034 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB1P08034 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB1P08034 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB1P08034 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB1P08034 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB1P08034 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB1P08034 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB1P08034 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB1P08034 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB1P08034 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB1P08034 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB1P08034 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB1P08034 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB1P08034 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB1P08034 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB1P08034 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJB1P08034 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJB1P08034 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB1P08034 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB1P08034 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB1P08034 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB1P08034 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB1P08034 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB1P08034 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB1P08034 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB1P08034 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB1P08034 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB1P08034 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB1P08034 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB1P08034 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB1P08034 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB1P08034 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB1P08034 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB1P08034 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB1P08034 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB1P08034 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB1P08034 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB1P08034 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB1P08034 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB1P08034 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB1P08034 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB1P08034 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB1P08034 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB1P08034 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB1P08034 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB1P08034 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms