Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPBP07199 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPBP07199 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPBP07199 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPBP07199 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPBP07199 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPBP07199 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPBP07199 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPBP07199 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPBP07199 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPBP07199 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPBP07199 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPBP07199 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPBP07199 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPBP07199 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPBP07199 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPBP07199 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBP07199 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBP07199 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBP07199 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBP07199 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBP07199 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBP07199 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBP07199 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBP07199 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBP07199 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBP07199 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBP07199 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBP07199 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBP07199 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBP07199 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBP07199 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBP07199 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBP07199 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBP07199 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBP07199 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBP07199 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBP07199 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBP07199 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBP07199 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBP07199 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBP07199 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBP07199 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPBP07199 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPBP07199 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPBP07199 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPBP07199 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPBP07199 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPBP07199 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPBP07199 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPBP07199 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPBP07199 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPBP07199 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPBP07199 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPBP07199 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPBP07199 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPBP07199 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPBP07199 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPBP07199 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPBP07199 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPBP07199 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPBP07199 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPBP07199 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPBP07199 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPBP07199 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPBP07199 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPBP07199 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPBP07199 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPBP07199 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPBP07199 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPBP07199 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPBP07199 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPBP07199 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPBP07199 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPBP07199 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPBP07199 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPBP07199 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPBP07199 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPBP07199 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPBP07199 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPBP07199 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPBP07199 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPBP07199 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPBP07199 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPBP07199 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPBP07199 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPBP07199 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPBP07199 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPBP07199 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPBP07199 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPBP07199 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPBP07199 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPBP07199 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPBP07199 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CENPBP07199 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPBP07199 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPBP07199 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPBP07199 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPBP07199 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPBP07199 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms