Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFLP07196 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFLP07196 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFLP07196 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFLP07196 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFLP07196 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFLP07196 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFLP07196 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFLP07196 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFLP07196 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFLP07196 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFLP07196 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFLP07196 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFLP07196 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFLP07196 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFLP07196 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFLP07196 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFLP07196 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFLP07196 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFLP07196 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFLP07196 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFLP07196 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFLP07196 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFLP07196 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFLP07196 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFLP07196 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFLP07196 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFLP07196 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFLP07196 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFLP07196 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFLP07196 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFLP07196 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFLP07196 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFLP07196 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFLP07196 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFLP07196 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFLP07196 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFLP07196 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFLP07196 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFLP07196 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEFLP07196 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFLP07196 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFLP07196 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFLP07196 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFLP07196 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFLP07196 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFLP07196 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFLP07196 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFLP07196 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFLP07196 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFLP07196 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFLP07196 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFLP07196 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFLP07196 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFLP07196 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFLP07196 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFLP07196 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFLP07196 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFLP07196 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFLP07196 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEFLP07196 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEFLP07196 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEFLP07196 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEFLP07196 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEFLP07196 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEFLP07196 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFLP07196 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFLP07196 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFLP07196 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFLP07196 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFLP07196 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFLP07196 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFLP07196 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFLP07196 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFLP07196 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFLP07196 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFLP07196 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFLP07196 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFLP07196 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFLP07196 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFLP07196 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFLP07196 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFLP07196 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEFLP07196 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFLP07196 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFLP07196 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFLP07196 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFLP07196 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFLP07196 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFLP07196 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFLP07196 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFLP07196 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFLP07196 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFLP07196 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFLP07196 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFLP07196 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFLP07196 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEFLP07196 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFLP07196 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFLP07196 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms