Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-7P01780 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms