Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KA4O75676 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KA4O75676 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms