Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms