Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP3O75154 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP3O75154 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms