Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF3O75054 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms