Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX15O60248 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX15O60248 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms