Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms