Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR2O43760 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms