Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD8O14715 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RGPD8O14715 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RGPD8O14715 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RGPD8O14715 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD8O14715 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD8O14715 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD8O14715 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD8O14715 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD8O14715 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD8O14715 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD8O14715 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD8O14715 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD8O14715 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD8O14715 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD8O14715 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD8O14715 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD8O14715 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD8O14715 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms