Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF5O00463 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms