Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN8O00124 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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