Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms