Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms