Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARID3CA6NKF2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms