Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L4A6NCW7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms