Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.33■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms