Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF22A3QJZ6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms