Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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