Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms