Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms