Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUBP2Q9Y5Y2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms