Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AFG3L2Q9Y4W6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms