Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG4BQ9Y4P1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms