Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG6Q9Y2V7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms